UBB

UBB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KHW, 2MBB, 2MRO, 2MSG, 4UEL, 4UF6, 4WLR, 4WUR, 4ZPZ, 5CAW, 3OJ3, 5DK8, 5CRA, 4ZFR, 5CVO, 3ZLZ, 4WHV, 4ZFT, 3ZNH, 5D0M, 2Y5B, 2KWV, 5D0K, 5DFL, 5CVM, 4WZP, 5EDV, 5CVN, 2KWU, 4XOF, 5BNB, 2N13, 4ZUX, 5IFR, 5IBK, 5KGF, 5JG6, 5K9P, 5E6J
Ідентифікатори
Символи	UBB, HEL-S-50, Ubiquitin B
Зовнішні ІД	OMIM: 191339 MGI: 98888 HomoloGene: 75104 GeneCards: UBB
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein tag • ubiquitin protein ligase binding Клітинна компонента • цитоплазма • endocytic vesicle membrane • гіалоплазма • мітохондрія • neuron projection • клітинне ядро • екзосома • клітинна мембрана • нуклеоплазма • neuronal cell body • endosome membrane • міжклітинний простір • мітохондріальна зовнішня мембрана • endoplasmic reticulum quality control compartment • везикула • endoplasmic reticulum membrane • host cell Біологічний процес • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • interstrand cross-link repair • nucleotide-excision repair, DNA damage recognition • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • regulation of type I interferon production • positive regulation of protein monoubiquitination • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • Fc-epsilon receptor signaling pathway • endosomal transport • global genome nucleotide-excision repair • NIK/NF-kappaB signaling • G2/M transition of mitotic cell cycle • stress-activated MAPK cascade • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • macroautophagy • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • nucleotide-excision repair, DNA gap filling • error-free translesion synthesis • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • JNK cascade • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • nucleotide-excision repair, DNA incision • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • вроджений імунітет • Сигнальний шлях Notch • neuron projection morphogenesis • regulation of mRNA stability • protein polyubiquitination • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • virion assembly • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • negative regulation of type I interferon production • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway • positive regulation of protein ubiquitination • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of proteasomal protein catabolic process • GO:0019067 viral life cycle • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • error-prone translesion synthesis • MAPK cascade • regulation of mitochondrial membrane potential • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • ion transmembrane transport • glycogen biosynthetic process • regulation of neuron death • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • translesion synthesis • transcription-coupled nucleotide-excision repair • mitochondrion transport along microtubule • T cell receptor signaling pathway • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of signal transduction by p53 class mediator • positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • Wnt signaling pathway • nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • ERBB2 signaling pathway • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • згортання білків • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • Убіквітин-залежний протеоліз • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • entry of bacterium into host cell • трансмембранний транспорт • regulation of necroptotic process • membrane organization • endoplasmic reticulum mannose trimming • cellular iron ion homeostasis • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • protein targeting to peroxisome • male meiosis I • female meiosis I • male gonad development • female gonad development • cytokine-mediated signaling pathway • modification-dependent protein catabolic process • hypothalamus gonadotrophin-releasing hormone neuron development • adipose tissue development • fat pad development • interleukin-1-mediated signaling pathway • seminiferous tubule development • energy homeostasis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7314	22187
Ensembl	ENSG00000170315	ENSMUSG00000019505
UniProt	P0CG47	P0CG49
RefSeq (мРНК)	NM_018955 NM_001281716 NM_001281717 NM_001281718 NM_001281719 NM_001281720	NM_011664 NM_001313984
RefSeq (білок)	NP_001268645 NP_001268646 NP_001268647 NP_001268648 NP_001268649 NP_061828	NP_001300913 NP_035794
Локус (UCSC)	Хр. 17: 16.38 – 16.38 Mb	Хр. 11: 62.44 – 62.44 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

UBB (англ. Ubiquitin B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 229 амінокислот, а молекулярна маса — 25 762.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQIFVKTLTG		KTITLEVEPS		DTIENVKAKI		QDKEGIPPDQ		QRLIFAGKQL
EDGRTLSDYN		IQKESTLHLV		LRLRGGMQIF		VKTLTGKTIT		LEVEPSDTIE
NVKAKIQDKE		GIPPDQQRLI		FAGKQLEDGR		TLSDYNIQKE		STLHLVLRLR
GGMQIFVKTL		TGKTITLEVE		PSDTIENVKA		KIQDKEGIPP		DQQRLIFAGK
QLEDGRTLSD		YNIQKESTLH		LVLRLRGGC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Baker R.T., Board P.G. (1987). The human ubiquitin gene family: structure of a gene and pseudogenes from the Ub B subfamily. Nucleic Acids Res. 15: 443—463. PMID 3029682 DOI:10.1093/nar/15.2.443
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Schlesinger D.H., Goldstein G. (1975). Molecular conservation of 74 amino acid sequence of ubiquitin between cattle and man. Nature. 255: 423—424. PMID 1128706 DOI:10.1038/255423a0
• Huang F., Kirkpatrick D., Jiang X., Gygi S.P., Sorkin A. (2006). Differential regulation of EGF receptor internalization and degradation by multiubiquitination within the kinase domain. Mol. Cell. 21: 737—748. PMID 16543144 DOI:10.1016/j.molcel.2006.02.018
• Okumura F., Hatakeyama S., Matsumoto M., Kamura T., Nakayama K. (2004). Functional regulation of FEZ1 by the U-box-type ubiquitin ligase E4B contributes to neuritogenesis. J. Biol. Chem. 279: 53533—53543. PMID 15466860 DOI:10.1074/jbc.M402916200
• Komander D. (2009). The emerging complexity of protein ubiquitination. Biochem. Soc. Trans. 37: 937—953. PMID 19754430 DOI:10.1042/BST0370937

Див. також

• Хромосома 17