[[砲弾]]の装填は装填手が手動で行い、射撃後の空[[薬莢]]を邪魔にならないよう[[砲塔]]後部の小ハッチから自動的に排出する機構（自動排莢装置）は射撃速度の向上に大いに貢献するとされていたが、排莢時は砲身の仰角を最大にしなければ機構が作動しないため、排莢後にはそのつど砲身角度を戻さねばならず、かといって排莢作業を手動で行うには砲塔内容積の余裕のなさが装填手の作業に悪影響を与え、砲塔内の狭さは装填作業にも多大な影響を与えたため、かえって射撃速度が低下する結果となった。また、射撃後に砲身角度を一定に保てない事は、同一目標への連続射撃を大いに阻害することになった。[[自動装填装置]]を持つ他の戦車でも射撃後の排莢・装填時には砲身を規定角度に戻す必要があるが、現代の戦車では自動的に元の位置に素早く復旧されるのに対し、T-62では砲安定装置の機能がそこまで進んでいなかった。また、空薬莢の排出ハッチが作動して開くと砲塔部に開口部ができることになり、[[規制が議論されている兵器|NBC兵器]]で汚染された状況下では運用に難があった。砲塔内部にはT-55と同様にNBC防御用PAZシステムを装備し、設置場所はT-55の砲塔右前方から、砲塔後部の排莢ハッチ下へ変更された。